① EXCELファイルを指定して自動的にインポートしたい
「読み込むファイルの先頭行はフィールド名ですか?」を「はい(1行目が項目名になっていれば自動で選択されるはず)」にして、取り込むワークシート1行目をアプリのフィールド名(フィールドコードではありません)と同じにすれば対応するフィールドが最初から選択された状態になります。
文字列フィールド等は簡単に設定できますが、チェックボックスや複数選択等は少し癖があります(一度kintoneからcsvに書き出して確認されると分かりやすいです)。
② レイアウトの違う複数のEXCELファイルを同一アプリ内にインポートしたい
①の機能を使えば自ずと解消されるかと思います。
③ EXCELファイルからデータ登録する際に、EXCELの値を変更したり、条件にあった** 行だけをインポートしたい。**
こちらに関しては、Excelファイル側でその整形を行った方が良いと思います。